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본 발명에 따른 영상 표적 추출 시스템은 동일 시간과 동일 장면의 원본 영상을 서로 다른 주파수 대역으로 획득하는 복수의 영상 센서, 차영상을 이용한 관심 영역 검출법에 따라 상기 각 원본 영상에 대해 프레임간 정합, 차영상 생성, 이진화 순으로 영상 처리한 후 상기 영상 처리된 각 처리 영상을 합성하여 하나의 통합 영상을 생성하고 상기 통합 영상으로부터 관심 영역(ROI, Region Of Interest)을 추출하는 관심 영역 추출기 및 상기 각 원본 영상에서 상기 관심 영역에 대응되는 영역의 유사도 영상과 상기 각 처리 영상에서 상기 관심 영역에 대응되는 영역의 관심 처리 영상을 각 영상 센서별로 매칭시킨 후 합쳐 매칭 영상을 생성하고, 상기 통합 영상에서 상기 관심 영역의 인접도 영상을 상기 매칭 영상과 합쳐 상기 관심 영역에서 표적과 배경을 분할하고 상기 표적을 추출하는 표적 분할기를 포함함으로써, 영상 내에서 표적을 정확하게 추출할 수 있다.