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본 발명은 대기 중의 부유입자를 흡입하여 농축한 후 이송된 단일 입자에 레이저빔을 조사하여 발생한 산란광과 함께 미약한 형광을 모아 이를 다수의 파장대별로 분리하여 부유입자에 포함된 생물입자를 실시간으로 신속하고 확실하게 검출할 수 있는 형광검출장치를 제공한다. 본 발명에 따른 형광검출장치는 대기 중의 부유입자를 선별 농축하는 입자농축부; 입자농축부 하단에 설치되는 입자광측부; 를 포함하고, 입자광측부는 입자농축부에서 선별 농축된 입자 및 공기를 유입하기 위한 노즐을 갖는 입자도입부; 입자도입부의 하단과 연결되며 내부에 입자측정공간을 갖는 광학챔버; 광학챔버의 전면에 연결 설치되어 입자측정공간 내에 도입되는 입자에 레이저빔을 조사하기 위한 빔형성광학계; 빔형성광학계에 대향하여 광학챔버의 후면에 연결 설치되어 빔형성광학계로부터 조사되는 레이저빔을 빔을 소멸시키기 위한 빔흡수계; 입자측정공간 내에 레이저빔의 진행방향과 90°방향으로 배치된 한 쌍의 반사경; 광학챔버의 하면에 연결 설치되어 입자측정공간에서 레이저빔과의 상호작용을 한 후의 입자와 공기를 노즐을 통하여 외부로 토출시키기 위한 입자토출부; 광학챔버의 우측면에 연결 설치되어 입자측정공간에서 레이저빔과 입자와의 상호작용에 의해 생성된 산란광과 형광 신호를 동시에 검출하는 산란광검출기와 형광검출기를 구비하는 빔분리광학계; 를 포함하는 것을 특징으로 한다.